▲ 인실리코메디슨의 논문 표지, 신종코로나바이러스 치료물질 인공지능으로 개발 중

신종코로나바이러스 치료 물질 공동연구할 팀을 찾는다: Generative Deep Learning 접근법을 사용하여 설계된 잠재적 2019-nCoV 3C 유사 프로테아제 억제제 개발 중

프리 프린트
 Preprint에 제출된 논문:   게시  에 의해 알렉스 자보론코프 블라디미르 Aladinskiy 알렉산더 Zhebrak 보그 Zagribelnyy 빅터 Terentiev 드미트리 S. Bezrukov 다닐 Polykovskiy 림 Shayakhmetov 안드레이 Filimonov 보낸 필립 오레 호브 일린 얀 올가 포포 쿠엔틴 Vanhaelen 알렉스 Aliper 얀 Ivanenkov

신종코로나바이러스의 치료약이 없고 백신도 없다. 그런데 인공지능을 이용하여 신약개발을 주도하는 인실리코 메디슨은 백신이나 알려진 효과적인 치료법이없는 2019 신종코로나바이러스 (2019-nCoV)의 출현으로 새로운 약물 발견 접근법에 대한 시급함이 생겼다. 

가장 중요한 2019-nCoV 단백질 표적 중 하나는 결정 구조가 알려진 3C 유사 프로테아제이다. 즉각적인 노력의 대부분은 이미 알려진 임상적으로 승인된 약물, 즉 에이즈치료제 등을 사용하는 것이다. 그런데 인실리코메디슨은 약물 재순환 및 잘 작동하지 않을 수있는 화학물질 라이브러리에서 사용가능한 분자에 대한 가상 치료제 스크리닝에 중점을 둔다. 

예를 들어, 3C- 유사 프로테아제에 대한 HIV 프로테아제 억제제 인로피나비르의 IC50은 대략 50 마이크로 몰이다. 이 문제를 해결하기 위해 2020년 1월 28일 Insilico Medicine은 생성 화학 파이프 라인의 일부를 사용하여 2019-nCoV의 새로운 약물 유사 억제제를 설계 하였고, 1월 30일에 생성을 시작했다.

이미 이전에 검증된 생성화학 접근법중 3가지를 사용했다. 결정 유래P기반 생성기. 위와 같은 동성 모델링기반 생성및 리간드기반 생성 등의 접근법을 사용하여 생상된 새로운
약물 유사화합물은 www.insilico.com/ncov-sprint/에 게시되고 있으며 지속적으로 업데이트 될 예정이다.

내부 자원을 사용하여 여러 분자가 합성되고 시험 될 것이다. 그러나 이 팀은 공개된 분자를 합성, 테스트 및 필요한 경우 최적화하기위한 협업팀을 찾고 있다. 내부 자원을 사용하여 여러 분자가 합성되고 시험 될 것이다. 

시급하게  이 팀은 공개된 분자를 합성, 테스트 및 필요한 경우 최적화하기위한 협업팀을 찾고 있는데 한국연락처는 unfutureforum@naver.com, 그리고 전화는 010-4019-9494이다. 인실리코메디슨의 CEO인  alex@insilico.com으로 연락할 수도 있다.


https://chemrxiv.org/articles/Potential_2019-nCoV_3C-like_Protease_Inhibitors_Designed_Using_Generative_Deep_Learning_Approaches/11829102/1

Potential 2019-nCoV 3C-like Protease Inhibitors Designed Using Generative Deep Learning Approaches

Preprint
 submitted on  and posted on  by Alex Zhavoronkov Vladimir Aladinskiy Alexander Zhebrak Bogdan Zagribelnyy Victor Terentiev Dmitry S. Bezrukov Daniil Polykovskiy Rim Shayakhmetov Andrey Filimonov Philipp Orekhov Yilin Yan Olga Popova Quentin Vanhaelen Alex Aliper Yan Ivanenkov

The emergence of the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV), for which there is no vaccine or any known effective treatment created a sense of urgency for novel drug discovery approaches. One of the most important 2019-nCoV protein targets is the 3C-like protease for which the crystal structure is known. Most of the immediate efforts are focused on drug repurposing of known clinically-approved drugs and virtual screening for the molecules available from chemical libraries that may not work well. For example, the IC50 of lopinavir, an HIV protease inhibitor, against the 3C-like protease is approximately 50 micromolar. In an attempt to address this challenge, on January 28th, 2020 Insilico Medicine decided to utilize a part of its generative chemistry pipeline to design novel drug-like inhibitors of 2019-nCoV and started generation on January 30th. It utilized three of its previously validated generative chemistry approaches: crystal-derived pocked- based generator, homology modelling-based generation, and ligand-based generation. Novel druglike compounds generated using these approaches are being published at www.insilico.com/ncov-sprint/ and will be continuously updated. Several molecules will be synthesized and tested using the internal resources; however, the team is seeking collaborations to synthesize, test, and, if needed, optimize the published molecules.

TIMELINE

Submission date
10.02.2020
First online date
Posted date
11.02.2020

EMAIL ADDRESS OF SUBMITTING AUTHOR

INSTITUTION

Insilico Medicine

COUNTRY

Hong Kong, China

ORCID FOR SUBMITTING AUTHOR

0000-0001-7067-8966

DECLARATION OF CONFLICT OF INTEREST

All authors are affiliated with Insilico Medicine Hong Kong Ltd, a company developing an AI-based end-to-end integrated pipeline for drug discovery and development and engaged in aging and cancer research.
입력 : 2020.02.12 08:50
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